Molecular Design

Concepts and Applications

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Concepts and Applications

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Kleine Moleküle für Einsteiger: Dieser für Lehre und Selbststudium gleichermaßen geeignete Band behandelt den computergestützten Entwurf von Wirkstoffen, Enzyminhibitoren, Sonden und Markern für Biomoleküle und führt den Leser bis zum ersten eigenen De-Novo-Design eines funktionellen Moleküls. Gestützt auf lange Erfahrung im Molecular-Modeling-Umfeld erläutern die Autoren, welche Fragen mit den beschriebenen Methoden beantwortet werden können (und welche nicht).

Molecular Objects and Design Objectives
- Molecular geometry and surface
- Molecular properties
- The concept of drug-likeness
- Representing molecules as strings
 
Receptor-Ligand Interaction
- Thermodynamics of protein-ligand interaction
- QSAR: estimating quantitative structure-activity relationships
- The biophore concept
- Pharmacophores
 
Creating the Design
- Rational drug design
- Ligand-based design of compound libraries
- Transition state analogs
- de novo design
 
Virtual Screening
- Similarity searching
- Pharmacophore-based virtual screening
- Molecular docking and scoring
- Structure-based vs. ligand-based design
- Case study 1: design of Kv1.5 ion channel modulators
- Case study 2: virtual screening of a natural-product derived combinatorial library for novel 5-lipoxygenase inhibitors
- Case study 3: scaffold de novo design for cannabinoid-1 (CB-1) receptor ligands
 
Secondary design constraints and machine learning
- Introduction to Pharmacokinetics
- Prodrugs and bioisosters
- Machine learning methods
- Case study 1: predicting cross-activities of allosteric modulators of metabotropic glutamate receptors (mGluR)
- Case study 2: dopamine D3 antagonists and ACE inhbitors
 
ISBN 9783527314324
Artikelnummer 9783527314324
Medientyp Buch
Auflage 1. Auflage
Copyrightjahr 2008
Verlag Wiley-VCH
Umfang XV, 262 Seiten
Abbildungen 44 SW-Abb., 115 Farbabb., 19 Tabellen
Sprache Englisch